薑玫來看望秦曉陽，也通報給他兩個消息。因為上次和趙大鵬朱麗彤一起的聯合行動成功營救了W國50多名平民的生命，所以秦曉陽被授予了個人二等功。同時由於暗網平台的恢複，之前已經在調查...的幾十件暗網交易，除了已經抓到幕後黑手,的7宗，其它的都石沉大海，再次中斷了線索。秦曉陽知道這意味著軍火和毒品又會大量流入市場，心情也很是繁重。薑玫告訴秦曉陽，趙大鵬犧牲前已經向組織申請讓秦曉陽重新回歸天狼，而秦曉陽這次的精彩表示也讓天狼重新接納了他。然則秦曉陽依舊有心結在，薑玫讓他好好想想，能力越大責任越大。
秦曉陽重複無常思考，終於過了自己的心理關，重新回到了天狼二隊。戰友們看到他回歸都很開心，薑玫看到秦曉陽也很想上去和他打招呼，然則想想兩人如今複雜的關係，還是選擇了默默離開。
回到數據中心，程柳把已經分析好,的關於超級市場木馬解凍的情況申報發給了薑玫，薑玫看到程柳,的申報大吃一驚，要來了原始數據自己分析，最後得出了一個難以置信的結果。薑玫急忙把情況彙報給常建安，原來薑玫通過三個小時的分析，認出了這種讚助木馬解凍...的編碼方式，而這熟悉...的編碼運用最熟練的人薑玫認識兩個，就是唐石和秦曉陽。常建安不動聲色讓薑玫先繼續工作，自己和高顧問商量。原來W國的消息也傳到了這裏，唐石原來被列為W國反恐軍隊,的陣亡名單，然則如今W國-的情報部門卻把他重新歸類為了通緝犯，結合薑玫給到...的信息，常建安和高顧問懷疑唐石就是伯戈洛夫的臥底，並且他們獲得了另外一個消息，唐石原本在國內的家人突然申請了去M國，這更加重了唐石的嫌疑。
薑玫來找秦曉陽，告訴了他唐石家人要出國的消息，邀請秦曉陽和自己一起去機場送別唐石...的奶奶和弟弟。秦曉陽這才從唐石奶奶這裏知道唐石在W國的撫恤金下來了，有人通知他們幫唐糖安排好了在M國治病的事情，讓他們一起去M國。兩人送唐糖和奶奶離開，並沒想到他們這一去是落入了圈套。
唐石通過這段時間對超級市場的研究，察覺暗網的服務器應該是在W國-的荒山裏，他向伯戈洛夫提出要去操縱中心看看超級市場-的底層代碼，伯戈洛夫卻還沒有信任唐石到這種水平，堅持讓他隻負責研發最新的超級市場3.0就行。唐石提醒伯戈洛夫，自己和他是平等關係，伯戈洛夫卻給唐石看了一段視頻，主人公正是唐石的奶奶和弟弟。伯戈洛夫警告唐石，如果他乖乖替自己幹活，他...的家人就會在M國過得好好的，並且也告訴唐石不消費力尋找，他是找不到自己家人的。
唐石回到住處心亂如麻，不甘心就這樣被伯戈洛夫操縱的唐石決定根據自己找到的線索硬闖操縱中心，拿到暗網平台的底層代碼，擁有可以和伯戈洛夫談條件的籌碼。唐石依靠高超-的電腦水平和敏捷的身手一路混進了操縱中心，然而他很快就被機警的二號察覺了。王鐸不知道他到底是什麼人，然則敢闖暗網的操縱中心，應該也是恐懼分子的敵人，王鐸隻利用攝像頭觀察著唐石在操縱中心的動作，卻沒有揭穿他。唐石很快找到了主機機房，他準備複製底層代碼。王鐸之前在超級市場2.0裏加裝了一個偵測係統，在不知道對方身份的情況下，為了幸免自己的秘密曝光，王鐸隻能選擇按響了警報器，大批警衛立刻開始對唐石進行圍追切斷，二號通過唐石的電腦和他交流，讚助他逃脫了警衛-的跟蹤追殺順利逃離了操縱中心。
唐石經曆了有驚無險的一夜終於回到了自己的住處，卻察覺宋安琪正等在那裏。宋安琪早就猜到唐石不會就這樣向伯戈洛夫低頭，她也知道了操縱中心被入侵的事情，第一個就想到了唐石。宋安琪擔憂的是伯戈洛夫也會想到這一點，這樣唐石就麵臨著極大的危險。
伯戈洛夫知道唐石不會這樣罷休，他主動讓王鐸關停了超級市場，然後約見唐石。伯戈洛夫所圖很大，他對中國和W國聯合反恐很是忌憚，於是他準備用同樣的方法來報複給自己造成重大損失的中國武警。伯戈洛夫向唐石說明，自己已經運用手下的不知名企業暗中收購了一家中國公司冰峰，而這個冰峰公司目前正在和中國武警數據中心聯合開發一款軟件，伯戈洛夫希望唐石能做這個公司的總經理，然後利用和武警合作...的機會，把木馬植入武警中心的電腦，侵入他們的衛星係統。唐石雖然在和KK集團合作，然則天性善良的他卻沒想過真的要和自己的祖國作對，心裏很是矛盾，然則伯戈洛夫拿家人威脅唐石，讓他無路可退。
二號把有人夜闖操縱中心的事情上報給了反恐中心，因為唐石一路回避著攝像頭，二號隻截取到了他背影的照片，這個神奇人和伯戈洛夫主動關閉超級市場一定有很大的關聯，然則這個人到底是誰，伯戈洛夫又為什麼要關閉超級市場，常建安和高顧問一時都難以判斷。