又名神的病曆簿2/上帝的處方2 ，計的是恬靜安寧的信州鬆本市，本莊醫院的資深內科醫生栗原一止（櫻井翔 飾）繼續專注醫療崗位上的工作同時，滿心期待妻子榛名（宮崎葵 飾）的腹中那個可愛新生命的到來。另一邊，洋溢著濃濃溫情的公寓禦嶽莊迎來了新的客人，學生屋久杉（濱田嶽 飾）的加入使公寓安寧如水的生活煥發別樣生機。
　　與此同時，本莊醫院也終於等到了新醫生的加盟。他叫近藤辰也（藤原龍也 飾），是一止的大學同學。當年的辰也被視為"醫學係的良心"，此前作為血液內科醫生和一止攜手進入東京的知名醫院。好友久別重逢，一止自然喜上心頭，誰知曾經熟悉的辰也竟變得如此陌生。每天到了下班時間後他立刻返回家中，也根本不搭理工作時間以外任何病患的訴求。為了病患全身心付出、甚至不惜犧牲個人生活的一止，怎麼也無法理解辰也現在的態度，兩個好友之間的衝突和爭吵在所難免。直到某天，辰也不顧護士的勸說執意返回家中，再也無法忍受的一止衝動地向好友潑了一杯咖啡，似乎冷靜下來的辰也則犀利地反問一止，進而道出了他發生如此巨大轉變的原因。那正是辰也和妻子千夏（吹石一惠 飾）另一段令人唏噓不已的故事。
　　這一天，一止在本莊醫院的恩師貫田誠太郎（柄本明 飾）突然病倒，一向將全部精力撲在病患身上的貫田醫生，總算和夫人千代（市毛良枝 飾）得到難得的夫妻相守的時間，隻可惜那點時間已經所剩無幾。
　　在工作和家人之間兩難取舍的辰也和千夏夫婦，為了工作而不得不犧牲家人的貫田和千夏，以及即將迎接新的家人到來的栗原夫婦。他們是醫生，更是普普通通的大眾中的一員。奔忙往複在生死攸關的醫療現場，卻必須在和家人的情感問題上疲於奔命，大費周章。一向不惜犧牲一切的一止，似乎更切實地品嚐到身為醫者的艱辛，同時更真切的體味到家人的意義。
　　生生死死，死死生生，生命正是這樣周而複始。他歡呼著新生，憑吊著死亡。在生死輪回的洪流中，以醫者的身份從前人手中繼承了承載著無限希望的神聖衣缽……
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