人類與妖獸的戰爭已進行了數千年。在未來世界，人類科技飛速發異，專門成立了特警隊來對付妖獸。而在長期的鬥爭中，妖獸亦分為兩派。一派融入人類社會，控製人類經濟命脈，但亦謀求與人類的和平相處；另一部分則來去無蹤，變化多端，罪惡累累，試圖消滅人類，獨霸世界。阿龍和阿強都是特警隊員，二人是出生入死的好兄弟，為警隊立下過汗馬功勞。不過他們倆的遭遇卻大不相同，阿龍深受特警隊長器重，而阿強因為母親是妖獸，而自己身體也遺傳了妖獸的基因，所以飽受歧視。阿強雖感到非常不公，但一直逆來順受。
　
　　特警隊計劃捉拿妖獸元大宗，這是一隻長期生活在人類社會裏的妖獸，已經成為一個大集團的董事長。其實特警們不知道，元大宗是向往妖獸與人類的和平的，但他的兒子鬼眾道卻是妖獸世界的激進分子，一直想挑起妖獸與人類的戰爭，以坐收漁利。此時，阿龍違反特警隊的紀律愛上了元大宗的助手——美麗的女妖獸幻姬，而阿強則涉嫌泄密被勒令停職，特警隊內部又出現叛徒。

　　鬼眾道趁元大宗被捕之際，建起範圍巨大的妖閉空間。在此空間中，時間迅速逆轉，人類將退化為猴子，從而無力再與妖獸抗衡。阿強救出元大宗，並同阿龍一起挫敗了鬼眾道的陰謀。人類與妖獸最終都領悟出隻有和平才能拯救世界。