花菱烈火，一個十六歲的高中生，一直都憧憬著在很久很久以前的戰亂時代， 存在著的一些不愛名譽和隻對君主忠心耿耿的忍者們，可是，烈火卻時常被四周的人取笑他是傻瓜忍者。烈火他有一項特別的技能， 就是能從手中擦出火燄來。
在某次的偶遇，烈火認識了擁有能醫治別人身體的超能力的少女，佐古下柳。並因為小柳的和藹，勇敢和善良，烈火決意成為小柳的忍者，並稱小柳為公主。
但當烈火在一間廢置的工廠中，告訴小柳他所擁有的能力的秘密時， 一個神秘的女人－－影法師出現了，她不但知道烈火的秘密，還打傷了烈火他們， 但由於影法師擁有不死之身，烈火無法擊倒她。而影法師在說了一些奇怪的話後， 便消失不見了。
回到學校，和烈火從小打到大的青梅竹馬－霧澤風子對於烈火成為小柳的專屬忍者，感到非常不滿，接受了影法師所贈的魔道具風神，成為了影法師的儡傀，去向烈火挑戰。風神的威力異常強勁，幸好最後烈火和一直喜歡風子的土門聯手， 救出了迷失的風子。
一波未平，一波又起，帥氣又機智的轉校生水鏡凍季也為了保護貌似亡姐的小柳，迫使烈火離開她，並為了使小柳更像他的亡姐，用自己的魔道具－－閻水，削去了小柳的一把長髮。不過，烈火最終也以自己的火燄打敗了水鏡，而且也削去水鏡的長髮報仇。
後來，烈火遇到了同樣對忍者極有興趣的代課老師立迫文夫，立迫老師邀請烈火和小柳到他家作客，並告訴了一些關於戰國時代中，虛幻的忍軍－－「火影」的一些資料。這時候，紅麗的手下，小金井薰和永井木蓮到來，捉去了小柳和立迫老師，也打傷了烈火和立迫的妻子。
為了拯救小柳和立迫老師，烈火，風子，土門以及水鏡凍季也決定前往紅麗的所在
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